A FUNDAPER é uma entidade civil, com personalidade jurídica de direito privado, sem fins lucrativos, com autonomia administrativa, financeira e patrimonial, constituída no dia 23 de outubro de 1998. Rege-se por seu estatuto, pelo regimento interno e pela legislação aplicável. O prazo de duração é indeterminado. Tem sede e foro na cidade de Cuiabá, Mato Grosso, e poderá manter representações em outros municípios. Celebra convênios, acordos ou contratos com pessoas físicas ou jurídicas de direito público ou privado, nacionais, internacionais e estrangeiras.

Apoiar programas, projetos de pesquisa, assistência técnica e extensão rural.

Realizar estudos, pesquisas e prestamos serviços técnicos que atendam as necessidades do setor.

Propiciar condições que favoreçam a formação e o aperfeiçoamento dos recursos humanos ligados às atividades agropecuárias, florestais e ambientais, nas áreas técnica e administrativa.

Prestar serviços de consultoria, de treinamento e/ou desenvolvimento de Pesquisa, Assistência Técnica, Extensão Rural e Fomento Agropecuário.

Promover e apoiar ações que visem a recuperação, conservação e preservação dos recursos naturais.

Proporciar apoio instrumental e técnico para a condução de estudos, pesquisas, consultorias e experimentos.